Vandens gręžinių įrengimo darbai Kaune prasidėjo 1950 m., kai įmonė "Melioracija", įsikūrusi Kauno centre, gavo du pirmuosius naujus gręžimo agregatus "AVB-3-100". Pirmasis šios įmonės gręžtinis šulinys buvo išgręžtas prie Jurbarko, antras Biržų rajone, po to- Molėtų MSV. Per metus buvo išgręžiama po 2-3 gręžtinius šulinius. 1953 m. įmonė "Melioracija" buvo reorganizuota į Respublikinę kaimo šulinių gręžimo statybos įmonę (tuo metu vadintą "Burselvodstroj").

Archyvuose esantys to meto gręžimo žurnalai ir gręžtinių šulinių perdavimo-priėmimo aktai byloja, kad 1956 m. tai jau buvo Respublikinis melioracijos ir vandens ūkio statybos trestas. 1956 m. gręžimo kontora iš Kauno buvo perkelta į Jonučius. 1963 m. gręžimo darbai perėjo į Geologijos valdybos kompetenciją, ir įmonė buvo pavadinta tuo metu susikūrusios Vakarų Lietuvos hidrogeologinės ekspedicijos Kauno partija. Tuo metu čia dirbo apie 50 žmonių. 1969 m. vietoj Kauno hidrogeologinės partijos buvo įkurta Kauno hidrogeologinė ekspedicija, o 1972 m. pastatyta nauja gamybinė bazė Rinkūnų kaime, Garliavos sen., Kauno rajone.

Gręžimo darbų organizavimo pradininkais Kaune buvo Kazys Pilkauskas, Pranas Dėdelė, Stasys Mockus, Vytas Vaškevičiaus, Juozas Karaliūnas ir kiti. Jų pavardes randame to meto dokumentuose artezinių gręžtinių šulinių perdavimo-priėmimo aktuose. K. Pilkauskas tapo pirmuoju Kauno hidrogeologinės ekspedicijos viršininku. Vėliau, baigę Vilniaus universiteto Gamtos mokslų fakultetą, čia atėjo dirbti Gediminas Maniukas, Jonas Banėnas, Eugenijus Skripkauskas ir kt. Aštuntame - devintame dešimtmetyje ekspedicijoje dirbo apie 200 darbuotojų, per metus buvo išgręžiama iki 200 gręžtinių šulinių.

1992 m. buvusi valstybinė įmonė pirmoji iš geologinių įmonių Lietuvoje buvo privatizuota. Šiuo metu bendrovėje dirba >50 aukštos kvalifikacijos darbuotojų, iš kurių 8 geologai, baigę Vilniaus universitetą, ir 10 patyrusių gręžėjų. Gamybiniai pastatai (administracinis pastatas, mechaninės dirbtuvės su garažais, sandėliai, katilinė, naftos produktų kolonėlė ir kt.) išdėstyti 4 ha teritorijoje netoli Kauno. Veikia atstovybės Vilniuje, Klaipėdoje, Panevėžyje. UAB "Kauno hidrogeologija" yra "WAVIN", "QVANTUM", "DEBE PUMPAR" firmų atstovai Lietuvoje.